重庆发布血橙高质量基因组
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shucai1.com
2024-05-29
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摘要：近日，国际权威学术期刊《ScientificData》（中文译名《科学数据》）发表重庆市农科院果树所柑橘创新团队（以下简称柑橘创新团队）学术论文《重要甜橙品种——血橙高质量染色体级别基因组》，首次在国际上公开发布血橙高质量基因组。“基因检测完整性达到98.2%，在基因组研究领域被评价为一组高质量基因组。”论文牵头人、柑橘创新团队首席专家洪林告诉记者。血橙属于甜橙类品种，酸甜适度、风味浓郁，富含的花……
近日，国际权威学术期刊《Scientific Data》（中文译名《科学数据》）发表重庆市农科院果树所柑橘创新团队（以下简称柑橘创新团队）学术论文《重要甜橙品种——血橙高质量染色体级别基因组》，首次在国际上公开发布血橙高质量基因组。
“基因检测完整性达到98.2%，在基因组研究领域被评价为一组高质量基因组。”论文牵头人、柑橘创新团队首席专家洪林告诉记者。
血橙属于甜橙类品种，酸甜适度、风味浓郁，富含的花青素能为人体带来多种益处，深受消费者青睐。重庆市特色水果产业技术体系创新团队首席专家、市农技站果树科科长孔文斌研究员介绍，国内血橙主要分布在川渝地区，种植总面积超过100万亩，其中重庆有40余万亩，居全市柑橘产业第二，涉及果农10万户左右。
据了解，目前国内种植的血橙多为意大利“塔罗科”血橙变异而来的“塔罗科”新系，这个品种推广已有10余年。为改良品种，近年来，柑橘创新团队一直在潜心开展血橙新品种选育，他们在重庆血橙主产区开展了一轮又一轮“海选”，试图找到优异的育种资源。2019年，他们在育种资源中偶然发现了一株自然变异株，其花青素含量更高，血色更深，糖度也更高。
利用该变异株，柑橘创新团队在江津、开州、万州的试验基地对12亩共500多棵血橙树进行了嫁接，随后逐年记录果实产量、甜度、花青素含量，以及果树的抗病性能等100余项数据。
经过连续4年试验观察，柑橘创新团队发现其性状稳定、特色鲜明，目前正在申请国家新品种权保护和品种登记，暂命名为“内秀”。
“它的优异性状十分突出！” 西南大学园艺园林学院曾明教授表示，“经检测，这个由变异株产生的血橙新品系，果实甜度为14.7，花青素含量为每升52.34毫克，都比目前主推品种‘塔罗科’新系要高，产量则与之相当。”
洪林说，新品系血橙的优异性状是由自然变异而来，团队想搞清楚究竟是什么基因在起作用，而国际上尚未有公开发布的高质量血橙基因组，于是柑橘创新团队采用三代基因测序技术，着手“内秀”血橙全基因组测序工作。他介绍，“这次血橙基因测序深度达到65×，共预测到30395个基因。65×的深度可以很好地覆盖基因组的完整信息，这意味着我们检测到的基因完整度、精确度更高。目前完整性达到98.2%，可以说是一组高质量的基因组。”
洪林还表示，对该基因组的深入研究，将不断揭开血橙基因的奥秘，有望挖掘到更多优异的遗传基因，从而培育出更多的优良血橙品种。
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