“云上黑山羊”基因身份证和50K育种芯片研发成功提高黑山羊精准育种水平和育种效率

来源：shucai1.com 2024-05-12 浏览：195 字号：T|T

摘要：为鉴定“云上黑山羊”纯种，有效开展种业市场监管，维护其品牌价值，省畜牧兽医科学院研究团队对我国南方主要的4个黑山羊品种（类群）160只个体进行深度基因组重测序获取各品种特异性位点后，对3072个样本进行分型检测，借助机器学习方法建立了“云上黑山羊”鉴定模型并完成模型的优化，挖掘出能够作为纯种“云上黑山羊”基因标识鉴定的26个SNP位点，最终研发出“云上黑山羊基因身份证”。目前该基因身份证鉴定成功率……

　　为鉴定“云上黑山羊”纯种，有效开展种业市场监管，维护其品牌价值，省畜牧兽医科学院研究团队对我国南方主要的4个黑山羊品种（类群）160只个体进行深度基因组重测序获取各品种特异性位点后，对3072个样本进行分型检测，借助机器学习方法建立了“云上黑山羊”鉴定模型并完成模型的优化，挖掘出能够作为纯种“云上黑山羊”基因标识鉴定的26个SNP位点，最终研发出“云上黑山羊基因身份证”。目前该基因身份证鉴定成功率达90%，是国内唯一开展“云上黑山羊”品种鉴定的试剂盒。

　　“云上黑山羊50K育种芯片”基于山羊通用芯片功能位点，融合了74个“云上黑山羊”繁殖性状、生长性状和基因身份证的功能位点共计50000个SNP位点，平均检出率可达98.77%，分型一致性可达99.30%，相较于通用芯片检测成本降低了三成。该芯片不但可用于“云上黑山羊”全基因组选择育种、重要经济性状功能基因挖掘，还可用于云南本地山羊种质资源创新利用与保护、亲缘关系鉴定等，是目前国内唯一一款“云上黑山羊”育种芯片，相较通用芯片，在降低分子育种成本、提高选种准确率方面优势明显。

　　“云上黑山羊”是由省畜牧兽医科学院联合省内多家单位历时22年培育的我国第一个肉用黑山羊新品种。2023年6月，该品种被农业农村部列为全国主导品种。近10年来，科研团队联合企业加大成果转化应用力度，在全国20余个省（区、市）和云南省120个县（市、区）累计推广“云上黑山羊”种羊15万余只，获综合经济效益300多亿元。云南省内覆盖面达93%，占全省山羊种羊市场的94%，累计带动1.5万户群众增收致富。

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